Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms