Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLTCQ00610 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLTCQ00610 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLTCQ00610 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CLTCQ00610 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLTCQ00610 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms