Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK17Q00537 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK17Q00537 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms