Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK6Q00534 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms