Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms