Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX6P78412 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX6P78412 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX6P78412 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX6P78412 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX6P78412 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX6P78412 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX6P78412 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX6P78412 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX6P78412 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX6P78412 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX6P78412 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX6P78412 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX6P78412 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX6P78412 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX6P78412 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms