Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PIP4K2BP78356 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms