Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SUMO1P63165 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SUMO1P63165 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms