Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms