Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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