Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2FP61218 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms