Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARF3P61204 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARF3P61204 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms