Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJA9P57773 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJA9P57773 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJA9P57773 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA9P57773 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA9P57773 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA9P57773 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA9P57773 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA9P57773 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA9P57773 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA9P57773 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA9P57773 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA9P57773 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJA9P57773 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms