Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN15P56746 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms