Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms