Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA4P52798 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms