Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2A1P52655 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2A1P52655 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms