Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC1P48995 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms