Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCLMP48507 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCLMP48507 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCLMP48507 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GCLMP48507 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCLMP48507 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCLMP48507 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCLMP48507 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCLMP48507 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms