Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms