Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms