Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDF5P43026 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDF5P43026 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDF5P43026 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms