Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms