Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTX2P32243 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTX2P32243 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTX2P32243 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms