Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMPK1P30085 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms