Protein–RNA interactions for Protein: P30050

RPL12, 60S ribosomal protein L12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL12P30050 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL12P30050 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL12P30050 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL12P30050 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL12P30050 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL12P30050 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL12P30050 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL12P30050 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL12P30050 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL12P30050 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL12P30050 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL12P30050 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL12P30050 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL12P30050 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms