Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGA1P29973 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms