Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMOD1P29536 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms