Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB2P29033 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB2P29033 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms