Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTX3P26022 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTX3P26022 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTX3P26022 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTX3P26022 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTX3P26022 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTX3P26022 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms