Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCHP24723 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCHP24723 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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