Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5F1P24539 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms