Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRZ1P23471 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRZ1P23471 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms