Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA6P23229 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms