Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD247P20963 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD247P20963 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD247P20963 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms