Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA1P20827 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms