Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF1BP20333 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF1BP20333 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms