Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XBP1P17861 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XBP1P17861 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XBP1P17861 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XBP1P17861 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XBP1P17861 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XBP1P17861 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XBP1P17861 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
XBP1P17861 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XBP1P17861 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
XBP1P17861 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XBP1P17861 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XBP1P17861 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms