Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTPS1P17812 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms