Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF3P17036 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms