Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA1P15085 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA1P15085 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms