Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAMP11215 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms