Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR2F1P10589 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms