Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GLI4P10075 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GLI4P10075 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GLI4P10075 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GLI4P10075 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms