Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI2P10070 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI2P10070 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI2P10070 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI2P10070 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI2P10070 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI2P10070 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI2P10070 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI2P10070 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GLI2P10070 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GLI2P10070 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI2P10070 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI2P10070 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI2P10070 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI2P10070 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI2P10070 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI2P10070 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI2P10070 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI2P10070 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI2P10070 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI2P10070 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI2P10070 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI2P10070 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI2P10070 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI2P10070 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI2P10070 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI2P10070 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI2P10070 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI2P10070 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLI2P10070 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms