Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C4BP0C0L5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C4BP0C0L5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms