Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms