Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NGFRP08138 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms