Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLK3P07288 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLK3P07288 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLK3P07288 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLK3P07288 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLK3P07288 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLK3P07288 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms