Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DOAP06340 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms